四大土司灭其一，播州改为遵义，但这播州之战乃是万历三十年，损耗钱粮无数才拿下的，难道现在又来一场播州之战什么的？
土司乃国中之国，省内藩镇，历代皇帝和巡抚，无不有改土归流之心，但终因抯力极大而终止，但是朝廷一有机会，觑上了空子，就会扑上去，改土归流，平定地方之乱肇。
特别严重的是，贵州一带唐、宋、元诸朝均以土司羁縻，未置郡县（土府、土县亦是土司管辖），太祖洪武五年，贵州安、宋、田、杨四大土司内附，朝廷仍元旧例，封宣慰使，令其自领其土，自管其民。
虽然大明初中央权力尚不足以直接控制贵州，但朝廷从未放弃改土归流的努力，太祖洪武初，蒙元残余势力盘踞云南，仍欲负隅顽抗。而要征云南，最便捷、安全的一条路需经过贵州，这使得朱元璋动意经略贵州。他先是开辟自中原通往黔、滇的驿道，以加强对这一地区的控制。
洪武十五年，更是将凯旋的伐滇军队三十万余人，分散安置在贵州一带驻守，这些军队成为贵州卫所的基础。与此同时，朝廷又将军人家属自中原迁入贵州，划归卫所管理，与本地原有的土官管理体系分开。虽然没有直接改土归流，但是相当于将一颗钉子楔入贵州，通过移民动摇了土官的统治基础。
同时，依靠这些卫所，朱元璋在贵州建立了都指挥使司，这是贵州三司建立的开端。
成祖永乐年间，思州、思南两宣慰司发生冲突，这两个宣慰司的首领都是黔南田氏家族的族人，不过分属于两支（两家在宋元之际就已经分家），他们因为丹砂矿的归属权大打出手，给了永乐皇帝出面干涉的借口。
最终，思州、思南两个宣慰司均被革除，宣慰使被收执，明廷采纳了夏元吉的意见，于永乐十一年，将原来的两个宣慰司共计三十三个长官司的辖地划分为八个府，并据此设立贵州承宣布政使司，这是贵州建省的重要一步，永乐十五年，为健全三司体制，建立贵州按察提刑使司，至此贵州省制完备。
但值得一提的是，贵州虽然仿照其他省份建立了三司体制，但是实际的权力很多还掌握在大大小小数百个土司手中，安、宋、田、杨四大土司仍具有影响力，比如播州杨氏在，曾在明中后期掀起叛乱，而大大小小的苗乱则与明廷相始终。除此之外，贵州的流官一般只设到府一级，县级设置很少，大部分府下设置长官司，实际权力还是掌握在土司手中。总而言之，明代贵州的改土归流虽然一直在推进，但是缓慢而艰难，并且存在一些改流复土的议论。
这是大明内部最复杂，最令人烦恼头痛之事，米柱却不合时宜的提出，令内阁相当头痛。
这永宁奢家、水西安家，拥兵上万，辖地数府，有造反的本钱和能力，但他们己臣服几百年了呀！俨如国中之王，土皇帝，何必造反？况且东厂的证据也不足，于是他们将备忘录转回四川布政使司、贵州布政使司，让他们多加注意，同时回复东厂，让他们找更多的证据。
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