刑部，掌管民间的各种诉讼的审核和最终判定，了解和处理民间的各项纠纷，简雍是诚信君子，从涿郡时就跟随了刘备，忠心耿耿，所以肖勇将吏部交给他掌管。
兵部，是后世情报部门和参谋部门的集合，不仅要负责收集天下各地的情报还要适时制定出恰当的战略方案，鉴于兵部的任务在这个时期是最重要的也是最繁重的，所以肖勇将目前刘备手下两个最杰出的谋士鲁肃和徐庶都放在了这里。
自从肖勇让鲁肃一人兼两职，鲁肃天天找肖勇诉苦，往后几天，肖勇被他烦的见到他就头也不回的跑。
户部，也就是财政部，它将对刘备军领地内的各项财政收支进行独立核算，并负责征收各种赋税，并派人审核各种建设的投资，这个部门当然是由商家出身的糜竺掌管。
工部，提出合理的建设意见并负责各种工程的建设、维护等，另外，肖勇还将工商业的发展也纳入到工部的管理范围之内，以李严的行政能力绝对是这个部门长官的首选。
六部直接对刘备负责，地位平等，互相监督、帮助而又互不干涉。
在经济方面，肖勇在农业方面实行了屯田制，即由政府提供土地和农具，耕牛，种子等，而无地的流民提供劳力，粮食的收成上交三成给政府。实际上这三成只是农具种子的本钱。而在政府登记耕种三年以上的就可以获得你耕种的土地。
由于黄巾起义的破坏，使得大量的良田成了无主的荒地，却也是的肖勇实行屯田制小了很多阻力，这个时代的百姓能拥有一块自己的地是多么高兴的事，肖勇的屯田制就给了他们这个希望，因此刘备军的领地里很快就聚集了大量的流民。屯田制看似对政府的收入并没有好处，但肖勇这招实际上为以最快的速度恢复生产力打下了基础，而且如此低的税收做到了藏富于民，为工商业的发展奠定了市场基础。
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